Для осуществления повышения квалификации в Центре созданы такие профильные отделения: педатрическое, общетерапевтическое, общехирургическое, лаборантское и общесанитарное, лечебного и акушерского дела, специализированных служб и выездных циклов.

Работники сферы здравоохранения со средним образованием могут получить здесь специализацию, пройти общее или тематическое усовершенствование. По завершении этих циклов проводят квалификационный сертификационный экзамен. Те слушатели, которые прошли проверочные испытания успешно, получают сертификат специалиста.

Средний медицинский персонал учреждений, которые относятся к московскому Департаменту здравоохранения, обучаются в Центре бесплатно, для прочих предусмотрена оплата по утвержденным Департаментом расценкам. Среди предлагаемых форм обучения присутствуют полный или частичный отрыв от работы, обучение в вечернее или дневное время.

Клиническая практика проводится в 47 лечебно-профилактических учреждениях Москвы, с современным техническим оснащением: многопрофильные специализированные и клинические больницы, учебные и научно-исследовательские институты, дома ребенка, диспансеры, городские поликлиники и тому подобное.